Транскрипционные факторы прокариот.

Узнавание ДНК белками в прокариотических системах. Роль структурного мотива " спираль-поворот-спираль" в узнавании белками нуклеотидной последовательности. Факторы, обуславливающие высокую специфичность узнавания ДНК белками. l-репрессор и Cro-белок. Аллостерический контроль связывания белков с ДНК. Репрессор триптофанового оперона, Lac-репрессор, репрессор метионинового оперона: участие b-тяжей в его взаимодействии с ДНК. САР-белок и его взаимодействие с ДНК.

Транскрипционные факторы эукариот.

Узнавание ДНК эукариотическими факторами транскрипции. Структура ТАТА-бокс-связывающего белка, его взаимодействие с ДНК. Белок р53 - его структура и взаимодействие с ДНК. Специфические факторы транскрипции эукариот. Транскрипционные факторы, содержащие мотив цинковых " пальцев" 1-го класса. Транскрипционные факторы с бинуклеарными цинковыми кластерами. Строение GAL4. Димеризация транскрипционных факторов с участием " лейциновых молний". Взаимодействие с ДНК и строение GCN4, MyoD, Max. Трансактивационные домены.

Антитела: структура, формирование разнообразия.

Антитела. Структура. Антиген-узнающие центры. Классы антител. Взаимодействие антиген-антитело. Гены, кодирующие антитела. Механизм возникновения разнообразия антиген-узнающих центров. V(D)J-рекомбинация, соматическая гипермутабельность V-генов. Аллельное исключение. Т-клеточные рецепторы.

Посттрансляционные модификации белков.

Фосфорилирование белков. Протеинкиназы и протеинфосфатазы, классификация. N- и О- гликозилирование белков. Углеводные сигналы сортинга белков. Йодирование и сульфатирование остатков тирозина. Образование остатков g-карбоксиглутаминовой кислоты. АДФ-рибозилирование белков. Липопротеины.

Сигнальные каскады клетки.

Представление о передачи внешних сигналов в клетку (ростовые факторы, молекулы адгезии, стероидные гормоны). Каскад MAP-киназ. Фосфоинозитидный путь, PI-3-киназа, киназа Akt. Jak-Stat путь и импорт активатора в ядро. Сигнальные белки TGFb и транскрипционные факторы Smads. Рецептор Notch и его участие в регуляции активности генов. Интеграция действия различных сигнальных путей в клетке.

Канцерогенез.

Фенотипические особенности опухолевой клетки. Причины возникновения опухоли, канцерогены. Генетическая нестабильность раковой клетки. Канцерогенез как микроэволюционный процесс. Стволовые опухолевые клетки. Онкогены и гены-супрессоры опухолевого роста. Роль белка p53. Метастазирование. Защита организма от опухолевых клеток.

Стволовые клетки.

Понятие о стволовых клетках. Отличительные особенности стволовых клеток, их классификация. Потентность. Ниша стволовой клетки. Индуцированные стволовые клетки, транскрипционные факторы, программирующие индукцию. Эпигенетика стволовых клеток. Индукция дифференцировки в культуре клеток.

 

Литература

Основная

1) Льюин Б. Гены (перевод 9 изд.). Изд. Бином: Лаборатория знаний, 896 с., 2011.

       Jocelyn E. Krebs, Elliott S. Goldstein, Stephen T. Kilpatrick. Lewin's GENES XI. Jones & Bartlett Learning, 940 p., 2012.

2) Harvey Lodish, Arnold Berk, Chris A. Kaiser, Monty Krieger, Anthony Bretscher, Hidde Ploegh, Angelika Amon, Matthew P. Scott. Molecular Cell Biology (7th ed.). W. H. Freeman, 973 p., 2012.

3) Жимулев И.Ф. Общая и молекулярная генетика (Изд. 4-е). Сибирское университетское издательство, Новосибирск, 479 с., 2007.

4) Спирин А.С. Молекулярная биология. Рибосомы и биосинтез белка. Изд. Академия, 512 с., 2011.

5) Степанов В. М. Молекулярная биология. Структура и функции белков. Изд. МГУ, Наука, 336 c., 2005.

 

Дополнительная

6) Alexander Gann, James D. Watson, Michael Levine, Stephen P. Bell, Tania A. Baker. Molecular Biology of the Gene (7th ed.). Benjamin-Cummings Publishing Company, 912 p., 2013.

7) Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Molecular Biology of the Cell (5th ed.). Garland Science, 1392 p., 2007.

8) Коряков Д.Е., Жимулев И.Ф. Хромосомы. Структура и функции. Издательство СО РАН, Новосибирск, 258 с., 2009.

9) Под ред. С. Дэвида Эллиса, Томаса Дженювейна, Дэнни Рейнберг. Эпигенетика. Техносфера, 496 с., 2010.

Ed. by C. David Allis, Thomas Jenuwein, Danny Reinberg, Marie-Laure Caparros. Epigenetics. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 502 p., 2007.

10) Разин С.В., Быстрицкий А.А. Хроматин: упакованный геном. Бином: Лаборатория знаний, 192 с., 2009.

11) Под ред. Б. Льюина, Л. Кассимериса, В. П. Лингаппа, Д. Плоппер. Клетки. Бином: Лаборатория знаний, 952 с., 2011.

Lynne Cassimeris, Vishwanath R. Lingappa, George Plopper. Lewin’s Cells (2^nd Ed.). Jones & Bartlett Learning, 1056 p., 2011.

12) Свердлов Е.Д. Взгляд на жизнь через окно генома. В 3 томах. Наука, 2009.

13) Браун Т.А. Геномы. ИКИ, 944 с., 2011.

T.A. Brown. Genomes 3. Garland Science, 736 p., 2006.

14) Gerald Karp., Cell and Molecular Biology: Concepts and Experiments (7^th Ed.). Wiley, 864 p., 2013.

15) Попов В.В. Геномика с молекулярно-генетическими основами (Изд. 2-е). Либроком, 298 c., 2012.

16) Патрушев Л.И. Экспрессия генов. Наука, 830 с., 2000.

17) Финкельштейн А.В., Птицын О.Б. Физика белка. КДУ, 524 с., 2012.

⇐ Предыдущая12345

Поделиться: