Предметный указатель к реферату

⇐ ПредыдущаяСтр 4 из 4

вычислительная геометрия, 6

люминесцентная микроскопия, 4

математическая морфология, 6

обработка изображения, 5

полутоновое изображение, 5, 8, 9

пороговая сегментация

Otsu, 6, 9

определение, 5

суммирование нормальных распределений, 6, 9

Программное обеспечение

CellAnalyser, 14

бесплатное открытое, 7

коммерческое, 7

сегментация

биологических объектов, 8

клеток, 9

опухоли, 9

ядер, 9

фильтрация

линейная пространственная, 5, 8, 9, 10

Интернет ресурсы в предметной области исследования

1. http: //vac.org.by – сайт Высшей аттестационной комиссии Республики Беларусь. Здесь собраны все нормативные акты, касающиеся оформления и защиты диссертаций.

2. http: //pubmed.org – текстовая база данных медицинских публикаций на английском языке, на основе раздела биотехнология национальной медицинской библиотеки США (National Library of Medicine, NLM). База данных была разработана национальным центром биотехнологической информации (National Center for Biotechnology Information, NCBI). PubMed является бесплатной версией базы данных MEDLINE.

3. http: //rsbweb.nih.gov/ij – общедоступная, основанная на Java программа для анализа и обработки изображений, разработанная в National Institutes of Health. ImageJ был создан с открытой архитектурой которая обеспечивает расширяемость при помощи плагинов Java, а также записываемых макросов. Архитектура плагинов ImageJ и встроенная в программу система разработки делает эту платформу весьма популярной для работы и преподавания анализа и обработки изображений.

4. http: //cellprofiler.org – общедоступная, основанная на Python программа для анализа и обработки изображений, использование которой не требует навыков программирования либо знаний о технологии обработки изображений. CellProfiler предназначен для широкого круга пользователей от разработчиков программного обеспечения до биологов.

5. http: //www.mathworks.com – сайт разработчика программного обеспечения в области численных вычислений и компьютерного моделирования. Программный пакет MatLab предоставляет пользователю большое количество (несколько сотен) функций для анализа данных, покрывающие практически все области математики.

6. http: //www.itlab.anitex.by/bioscan – это универсальная система редактирования, обработки и анализа изображений. Недостатки: отсутствует список опубликованных работ, подтверждающих качество реализованных алгоритмов; нет demo-версии.

7. http: //ieee.org/index.html – сайт Института инженеров по электротехнике и радиоэлектронике (The Institute of Electrical and Electronics Engineers, IEEE). В настоящее время в IEEE самое большое всемирное техническое общество учёных и исследователей, профессионально связанных с электротехникой, радиоэлектроникой, компьютерами. Главная цель IEEE – информационная и материальная поддержка специалистов для организации и развития научной деятельности в электротехнике, электронике, компьютерной технике и информатике, приложение их результатов для пользы общества, а также профессиональный рост членов IEEE. Институт IEEE публикует почти треть всей мировой технической литературы, ежегодно издаёт почти 140 журналов и 400 сборников трудов конференций. Главное достоинство материалов IEEE – высокое качество.

8. http: //www.bioinformatix.ru – сайт содержащий информацию о биоинформатике, геномике, протеомике, анализе медицинских и биологических изображений, биософте. Недостаток: сайт ориентирован на освещение событий на территории Российской Федерации.

9. http: //cran.r-project.org – сайт посвящённый языку программирования R для статистической обработки данных и работы с графикой, а также свободная программная среда вычислений с открытым исходным кодом в рамках проекта GNU. Статистические возможности R полностью покрывают возможности MatLab.

Действующий личный сайт в WWW

http: //eugenia-lisitsa.narod.ru

Граф научных интересов

магистранта Лисицы Е.В. факультета радиофизики и электроники

Специальность радиофизика

Смежные специальности

05.13.18 – математическое моделирование, численные методы и комплексы программ, физ.-мат., техн.

1. Эффективные численные методы и алгоритмы, компьютерные средства организации и проведения вычислительного эксперимента по исследованию научных и технических проблем (разработка, обоснование и тестирование). 2. Математические методы и вычислительные алгоритмы адаптации, проверки адекватности математических моделей объектов данным наблюдений, натурного эксперимента. 3. Математические методы и алгоритмы интерпретации натурного эксперимента, прогноза на основе его математической модели.

05.13.11 – математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей

1. Математическое и программное обеспечение систем искусственного интеллекта, мультимедиа, принятия решений, функционального и логического программирования, баз данных, знаний и экспертных систем 2. Создание системного математического и программного обеспечения, методов построения операционных систем, обеспечивающих эффективное использование ресурсов в ВМКСиС.

Основная специальность

05.00.13 – системный анализ, управление и обработка информации, физ.-мат., техн.

1. Методы и алгоритмы решения задач системного анализа, оптимизации, управления, принятия решений и обработки информации. 2. Специальное математическое и программное обеспечение систем анализа, оптимизации, управления, принятия решений и обработки информации. 3. Визуализация, трансформация и анализ информации на основе компьютерных методов обработки информации. 4. Методы получения, анализа и обработки экспертной информации.

Сопутствующие специальности

05.11.07 – оптические и оптико-электронные приборы и комплексы, физ.-мат.

1. Методы, оптические и оптоэлектронные приборы для формирования и обработки оптических изображений. 2. Лазерные и оптические комплексы для медицинских и биологических применений. 3. Оптические и спектроскопические аналитические методы, приборы и комплексы для экспресс-диагностики в медицине, управлении технологическими процессами, для контроля состояния окружающей среды.

03.00.25 – гистология, цитология, клеточная биология

1. Системный анализ взаимоотношений клеток и тканей в организме. 2. Разработка цитологических и гистологических методов исследования и экспериментальных моделей для изучения структурной организации и жизнедеятельности клеток и тканей.

Тестовые вопросы по Основам информационных технологий

< question type=" close" id=" 064" >

< text> 1 Какой из перечисленных ниже атрибутов устанавливает положение таблицы по отношению к полям документа< /text>

< answers type=" request" >

< answer id=" 1" right=" 0" > WIDTH < /answer>

< answer id=" 2" right=" 0" > BORDER < /answer>

< answer id=" 3" right=" 1" > ALIGN < /answer>

< answer id=" 4" right=" 0" > CELLSPACING < /answer>

< /answers>

< /question>

< question type=" close" id=" 564" >

< text> 2 Основные отличия ImageJ от других пакетов бесплатного программного обеспечения< /text>

< answers type=" request" >

< answer id=" 1" right=" 1" > Возможность внедрения пользовательских плагинов < /answer>

< answer id=" 2" right=" 0" > Не требует навыков программирования для разработки плагинов< /answer>

< answer id=" 3" right=" 1" > Возможность написания пользовательских макросов < /answer>

< answer id=" 4" right=" 0" > Открытая лицензия, позволяющая распространять как платно так и бесплатно разработанные плагины. < /answer>

< /answers>

< /question>

Презентация магистерской диссертации

Презентацию магистерской диссертации можно скачать по ссылке в Интернете или посмотреть в приложении.

Список литературы к выпускной работе

1. Феофанов, А. В. Спектральная лазерная сканирующая конфокальная микроскопия в биологических исследованиях/ А.В. Феофанов// Успехи биологической химии. т. 47. –2007. –С. 371-410.

2. Lamprecht, M. R. CellProfiler: free, versatile software for automated biological image analysis/ M. R. Lamprecht, David M. Sabatini, and Anne E. // Carpenter BioTechniques. –2007. – Vol. 42. –P.71-75.

3. Abramoff, M.D. Image processing with ImageJ/ M.D. Abramoff, P.J. Magalhaes, and S.J.Ram// Biophotonics International. –2004. –Vol. 11. – P. 36-42.

4. Ronneberger, O. Spatial quantitative analysis of fluorescently labeled nuclear structures: Problems, methods, pitfalls/ O. Ronneberger [et al.]// Chromosome Research. –2008. – Vol. 16. –P.523-562

5. Карнаухов, В.Н. Люминесцентный анализ клеток/ В.Н. Карнаухов. – Пущино: «Аналитическая микроскопия», 2002. – 131 с.

6. Штейн, Г. И. Конфокальная микроскопия: мифы и реальность/ Г. И. Штейн// Школа-семинар «Конфокальная микроскопия в биологии и медицине», –Москва 2005.

7. Абламейко, С.В. Обработка изображений: технология, методы, применение/ С.В. Абламейко, Д.М. Лагуновский. – Минск: «Амалфея», 2000. – 304 с.

8. Гонсалес, Р. Обработка изображений в среде MATLAB/ Р. Гонсалес, Р. Вудс, С. Эддинс. – Москва: Техносфера, 2006. –616 с.

9. Liao, P.S. A Fast Algorithm For Multilevel Thresholding / P.S. Liao [et al.] //Journal of Informational Science and Engineering. –2001. – Vol. 17, – P. 713-727.

10. Bishop, C. M. Pattern recognition and Machine Learning/ C. M. Bishop, –Springer, 2006. 735 pp.

11. Гилевский, С.В. Теория вероятностей и математическая статистика/ Гилевский С.В., Малофеев В. М. – Минск: БГУ, 2003. –174 c.

12. Vincent, L. Watersheds in Digital Spaces: An Efficient Algorithm Based on Immersion / L. Vincent and P. Soille. //IEEE Transaction on Pattern Analysis and Machine Intelligence. –1991. –Vol. 13, –P.583-598.

13. Пpепаpата, Ф. Вычислительная геометрия: Введение/ Ф. Пpепаpата, М.Шеймос. – Москва: Мир, 1989, –481 с.

14. Jones, T. R. Voronoi-Based Segmentation of Cells on Image Manifolds/ T. R. Jones// CVBIA, 2005.– P.535-543.

15. Carpenter, A. E. CellProfiler: image analysis software for identifying and quantifying cell phenotypes/ A. E. Carpenter [et al.]// Genome Biology. 2006. –Vol. 7. –P.100.1-100.10

16. Swedlow, J. R. Open source bioimage for cell biology/ J. R. Swedlow and Kevin W.Eliceiri//Trend Cell Biology. – 2009.–Vol. 19. –P. 656-660.

17. Лисица, Е. В. Сравнительный анализ методов сегментации биомедицинских изображений/ Е. В. Лисица// Сборник материалов 67-ой науч. конф. студентов и магистрантов БГУ. Минск. 2010.

Приложение

Презентация магистерской работы