Как было отмечено выше, анализируемые линии отличаются по статусу гена flamenco (см. табл.2.1.), линии MS(145) и SS (7K) имеют генотип flamenco-, а линия SS(C3(19)) генотип flamenco+. Таким образом, в линиях MS(145) и SS (7K) нарушен контроль транспозиционной активности gypsy , и при наличии активного gypsy, происходит его перемещение по геному. Однако, активный gypsy присутствует только в линии MS(145). Таким образом, анализируя эти линии, можно:
1. Сравнивая продолжительность жизни линии SS(7K) (генотип flamenco-, gypsy не перемещается, так как нет полноценной активной копии) с продолжительностью жизни линии SS (C3(19)) (генотип flamenco+) оценить влияние гена flamenco на анализируемый признак.
2. Сравнивая продолжительность жизни линии SS(7K) (генотип flamenco-, gypsy не перемещается, так как нет полноценной активной копии) с продолжительностью жизни линии MS (145) (генотип flamenco-, присутствует активная копия ретровируса gypsy , которая перемещается по геному) оценить влияние ретровируса gypsy на анализируемый признак.
Схема эксперимента анализа продолжительности жизни представлена на рисунке 3.16.
Рис.3.16. Схема эксперимента анализа продолжительности жизни.
Данные о продолжительности жизни каждой мухи в эксперименте представлены в Приложении 2. В таблице 3.1. представлены данные учета доли выборки мух, на протяжении всей их жизни.
Табл.3.1.
Коли- чество дней
Линия MS(145), самцы, %
Линия MS(145), самки, %
Линия SS(7K), самцы, %
Линия SS(7K), самки, %
Линия SS (С3(19)), самцы, %
Линия SS (С3(19)), самки, %
1
100,00
100,00
100,00
100,00
100,00
100,00
2
100,00
100,00
100,00
100,00
99,60
100,00
3
100,00
100,00
100,00
100,00
99,20
100,00
4
95,24
98,19
100,00
100,00
99,20
100,00
5
90,48
97,29
100,00
100,00
97,60
98,67
6
88,28
97,29
99,59
100,00
96,00
97,79
7
85,35
96,38
99,17
100,00
94,40
97,35
8
80,95
95,93
98,35
100,00
93,60
96,90
9
76,19
95,02
95,45
99,24
89,20
96,46
10
71,43
94,12
94,21
98,86
85,60
96,46
11
49,82
92,31
94,21
98,86
84,00
95,13
12
34,43
90,50
92,56
98,48
77,60
92,92
13
31,50
87,33
91,32
98,48
72,80
92,04
14
27,84
82,35
89,67
98,48
70,40
91,15
15
25,27
78,28
87,60
98,10
68,40
89,82
16
23,08
77,38
85,12
98,10
65,60
89,38
17
20,51
75,11
83,06
97,72
60,40
88,50
18
11,72
73,30
77,27
96,58
55,60
86,73
19
5,13
71,49
76,45
95,44
52,00
84,96
20
1,47
66,06
73,14
95,06
46,40
81,86
21
0,73
61,09
72,73
95,06
44,40
80,09
22
0,73
56,11
71,90
94,68
42,80
79,20
23
0,73
51,58
71,49
94,68
40,00
77,88
24
0,37
50,68
70,66
94,30
36,80
77,43
25
0,00
48,87
69,42
94,30
34,40
74,34
26
0,00
47,06
68,60
92,78
33,20
73,45
27
37,56
67,36
91,63
32,00
72,57
28
33,48
66,12
91,25
30,80
70,35
29
31,22
64,05
90,11
29,60
69,91
30
26,24
63,22
89,73
27,60
69,47
31
23,53
61,16
88,97
24,80
68,58
32
20,36
60,74
88,97
22,40
67,26
33
14,93
60,33
88,59
19,60
66,37
34
11,76
56,20
88,21
16,80
65,49
35
9,50
52,48
87,07
14,40
63,72
36
6,33
48,35
86,31
10,80
60,18
37
5,43
44,63
84,79
8,00
54,87
38
3,62
43,80
84,41
6,40
52,65
39
3,17
34,30
81,37
5,60
47,79
40
2,26
32,23
81,37
5,20
46,46
41
0,00
30,17
80,61
4,40
46,02
42
28,10
79,85
3,60
45,58
43
27,69
77,95
3,20
44,69
44
27,27
75,67
2,00
44,69
45
27,27
74,14
2,00
44,25
46
25,21
73,38
2,00
43,36
47
23,55
72,62
2,00
42,92
48
21,90
72,62
2,00
42,04
49
20,25
71,48
2,00
40,71
50
19,01
69,58
2,00
39,38
51
18,18
68,44
1,60
35,40
52
17,77
66,92
1,60
32,74
53
17,77
66,54
1,20
26,99
54
15,29
66,16
0,80
24,34
55
12,40
65,40
0,80
22,57
56
9,92
64,64
0,80
17,70
57
7,02
59,70
0,80
13,72
58
5,37
53,99
0,80
9,73
59
4,96
50,95
0,80
6,19
60
3,31
42,97
0,80
3,98
61
2,89
41,44
0,80
3,10
62
1,65
39,92
0,40
2,65
63
1,65
37,64
0,40
1,77
64
1,65
33,08
0,00
1,77
65
1,65
29,66
0,00
1,33
66
1,65
27,00
1,33
67
0,41
23,19
0,88
68
0,41
22,05
0,88
69
0,41
21,29
0,88
70
0,41
19,01
0,44
71
0,41
17,49
0,44
72
0,41
13,69
0,00
73
0,41
9,13
74
0,00
1,90
75
1,90
76
1,90
77
1,90
78
1,52
79
0,76
80
0,38
81
0,38
82
0,00
По результатам анализа были построены кривые выживаемости самцов и самок исследуемых линий (рис. 3.17.-3.19.)
Рис. 3.17. Кривые выживаемости самцов и самок линии MS (145)
Анализируя представленный график, видно, что самцы линии MS (145) живут меньше, чем самки линии MS (145).
Рис. 3.18. Кривые выживаемости самцов и самок линии SS (7K)
Анализируя представленный график, видно, что самцы линии SS (7K) живут меньше, чем самки линии SS (7K).
Рис. 3.19. Кривые выживаемости самцов и самок линии SS (C3(19))
Анализируя представленный график, видно, что самцы линии SS (C3(19)) живут меньше, чем самки линии (C3(19)).
Так как самцы и самки всех трех анализируемых линий живут неодинаково, анализ по линиям для самцов и самок производился раздельно. на рисунка 3.20 и 3.21 представлены результаты этого анализа.
Рис. 3.19. Кривые выживаемости самцов исследуемых линий
Рис. 3.19. Кривые выживаемости самок исследуемых линий
Анализируя графики видно, что линия MS (145) имеет минимальную продолжительность жизни, линия SS (7K) – максимальную, линия SS (C3(19)) имеет промежуточное значение.
Данные, представленные в Приложении 2, показывающие распределение продолжительности жизни по каждой линии каждого пола. В программе Microsoft Excel была проведена описательная статистика каждой из выборок, результаты показаны в таблицах 3.2-3.4.
Таблица 3.2.
Описательная статистика выборок линии MS(145)
Самцы MS (145)
Самки MS (145)
Среднее
12,21
Среднее
24,09
Стандартная ошибка
0,27
Стандартная ошибка
0,60
Медиана
11,00
Медиана
25,00
Мода
11,00
Мода
27,00
Стандартное отклонение
4,51
Стандартное отклонение
8,86
Дисперсия выборки
20,35
Дисперсия выборки
78,46
Эксцесс
-0,49
Эксцесс
-0,69
Асимметричность
0,21
Асимметричность
-0,21
Интервал
21,00
Интервал
37,00
Минимум
4,00
Минимум
4,00
Максимум
25,00
Максимум
41,00
Счет
273,00
Счет
221,00
Уровень надежности (95,0%)
0,54
Уровень надежности (95,0%)
1,17
Таблица 3.3.
Описательная статистика выборок линии SS(7K)
Самцы SS(7K)
Самки SS (7К)
Среднее
34,93
Среднее
55,61
Стандартная ошибка
1,00
Стандартная ошибка
0,99
Медиана
36,00
Медиана
60,00
Мода
39,00
Мода
60,00
Стандартное отклонение
15,53
Стандартное отклонение
16,10
Дисперсия выборки
241,12
Дисперсия выборки
259,20
Эксцесс
-0,88
Эксцесс
0,20
Асимметричность
0,06
Асимметричность
-0,93
Интервал
68,00
Интервал
73,00
Минимум
6,00
Минимум
9,00
Максимум
74,00
Максимум
82,00
Счет
242,00
Счет
263,00
Уровень надежности (95,0%)
1,97
Уровень надежности (95,0%)
1,95
Таблица 3.4.
Описательная статистика выборок линии SS(C3(19))
Самцы SS (C3(19))
Самки SS (C3(19))
Среднее
22,30
Среднее
39,57
Стандартная ошибка
0,71
Стандартная ошибка
1,10
Медиана
20,00
Медиана
39,00
Мода
12,00
Мода
53,00
Стандартное отклонение
11,28
Стандартное отклонение
16,55
Дисперсия выборки
127,14
Дисперсия выборки
273,87
Эксцесс
0,36
Эксцесс
-1,04
Асимметричность
0,71
Асимметричность
-0,33
Интервал
62,00
Интервал
67,00
Минимум
2,00
Минимум
5,00
Максимум
64,00
Максимум
72,00
Счет
250,00
Счет
226,00
Уровень надежности (95,0%)
1,40
Уровень надежности (95,0%)
2,17
Выборки были проверены на нормальность распределения критерием Колмогорова – Смирнова. Уровень значимости критерия у всех выборок p<0,05. Это означает, что распределение продолжительности жизни всех выборок статистически отличается от нормального распределения. Поэтому для оценки различий выборок использовался непараметрический критерий Манна – Уитни. В таблице 3.5. показаны результаты анализа по этому критерию.
Таблица 3.5.
Линия MS (145), самцы
Линия MS (145), самки
Линия SS (7K), самцы
Линия SS (7K), самки
Линия SS (С3(19)), самцы
Линия SS (С3(19)), самки
Линия MS (145), самцы
-
p<0,05
p<0,05
-
p<0,05
-
Линия MS (145), самки
p<0,05
-
-
p<0,05
-
p<0,05
Линия SS (7K), самцы
p<0,05
-
-
p<0,05
p<0,05
-
Линия SS (7K), самки
-
p<0,05
p<0,05
-
-
p<0,05
Линия SS (С3(19)), самцы
p<0,05
-
p<0,05
-
-
p<0,05
Линия SS (С3(19)), самки
-
p<0,05
-
p<0,05
p<0,05
-
Прочерки в таблице означает, что данные выборки не сравнивались. У всех выборок уровень значимости критериев p<0,05. Это означает, что продолжительность жизни самцов и самок одной линии статистически отличаются, а также что продолжительность жизни самок разных линий и самцов разных линий статистически отличаются.
ВЫВОДЫ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ 1 Результаты анализа транспозиции МГЭ (этап I )
В результатах присутствует термин «пороговое значение». Это означает, что анализировались ПЦР-фрагменты, имеющее значение большее, нежели пороговое, так как, как видно из рисунка 3.4. праймеры, были подобранны таким образом, что часть амплифицированной ДНК захватывала область элемента и именно эта область и является пороговым значением (измеряется в п.н.). На рисунках линия MS (145) обозначается как 145 линия, линия SS (7K) как 7K. Эксперимент ставился в 3-х проворностях.
Результаты по элементу Idefix.
пп.н.
пп.н.
пп.н.
Результаты по элементу 17,6.
Результаты по элементу rover.
Результаты по элементу springer.
Результаты по элементу gypsy.
Результаты по элементу Zam .
ПРИЛОЖЕНИЕ 2. Продолжительность жизни каждой мухи.
lektsia.com 2007 - 2024 год. Все материалы представленные на сайте исключительно с целью ознакомления читателями и не преследуют коммерческих целей или нарушение авторских прав! (2.845 с.)
Главная | Случайная страница | Обратная связь
