Мутагенез и методы выделения мутантов

Повышение продуктивности микроорганизма как продуцента сводится к селекции и мутагенезу. Селекционная работа с микроорганизмом состоит в поиске природных форм, которые обладают какими-либо полезными для человека свойствами (например, синтез БАВ, высокая скорость роста, способность усваивать дешевые среды и так далее, в дальнейшем совершенствовании его, в создании на его основе промышленных штаммов.

Методы современной селекции – это генетическое конструирование, когда можно изменить генетическую программу микроорганизма.

Генетическое конструирование в живой клетке in vivo включает получение и выделение мутантов с использованием различных способов обмена наследственной информацией живых микробных клеток.

Генетическое конструирование in vitro основано на применении генетической инженерии, которая манипулирует выделенной из организма ДНК. Каждый организм имеет свой генотип и фенотип

Биотехнолог для совершенствования биообъекта использует:

• наследственные изменения фенотипа, которое передается по наследству;

• наследственное изменение генотипа.

Мутации различают цитоплазматические (внехромосомные) и ядерные (хромосомные).

Наследственные изменения называются мутациями в геноме, но есть и внехромосомные изменения. Таким образом, мутации проявляются на субклеточном и молекулярном уровне. Хромосомные мутации включают три основных типа:

1. изменение числа хромосом

2. изменение числа и порядка расположения генов (перестройка хромосом ведет к структурным изменениям)

3. изменения индивидуальных генов (внутригенные изменения)

В селекции микроорганизмов основное значение имеют два последних типа мутаций.

Важной характеристикой мутантов является их способность к реверсии, то есть возвращения к исходному фенотипу (обратное мутирование). Мутанты, которые появляются в результате реверсии называются ревертантами

Современная селекция основана на выделении клоновых культур. Клон – это генетически однородное потомство одной клетки (это колония, выросшая из одной клетки). Клоновая культура, имеющая наследственную однородность, называется штаммом.

Типы мутаций:

1. Делеция (стирание) – выпадение участков хромосомы или нескольких генов.

2. Дупликация – удвоение генов.

3. Амплификация – умножение отдельных генов или группы генов.

4. Транспозиция - вставка участка хромосомы в новые места на хромосоме.

5. Инверсия – изменение порядка расположения генов на хромосоме, при этом может быть утрата одних функций и приобретение новых.

6. Летальные мутации – это мутации, захватывающие слишком большие участки генома, в результате чего организм погибает.

7. Внутригенные мутации:

• точечные – изменение последовательности нуклеотидов в пределах

одного гена.

• транзиция или трансверсия – выпадение или вставка одного или нескольких оснований, например, транзиция – пурин замещается напурин или пиримидин на пиримидин, трансверсия – пурин замещается на пиримидин.

Точечные мутации приводят к замене одной аминокислоты в белке на другую или к изменению конформации белковой молекулы, что может привести к потере активности фермента. Если белок регулятор или репрессор, то это может привести к повышению выработки целевого продукта продуцентом.

Вывод: совершенствование биообъекта – это получение биообъектов – продуцентов с мутациями в геноме, которые отличаются от исходного биообъекта в сторону улучшения биотехнологических свойств, в частности, в сторону увеличения образования целевого продукта.

Существуют традиционные методы совершенствования:

Естественный отбор – селекция.

Нормальная популяция м/о гетерогенна: «+» вариант несет желательный признак», « -» - вариант не несет нужного признака.

Рис.4

Вариации обусловлены спонтанными мутациями (неконтролируемые, внезапные или причины которых не установлены). Например, высевают на чашку Петри культуру жрожжей как нужный продукт, они образуют крупные и мелкие колонии. Нас интересуют мелкие колонии и их пересевают, они снова разделяются на крупные и мелкие колонии и эту операцию повторяют несколько раз. Это есть пример многоступенчатого естественного отбора. В результате у первичных колоний и колоний, получаемых после отбора обнаруживается разное соотношение «+» и « -» вариантов (+80/-20) и (+60/-40). У многих м/о существует система репарации или возврата - это обратная мутация или возврат к исходному дикому штамму. Если эта система имеется у м/о, то для преодоления этого явления необходимо

1. отбирать по нужному биотехнологическому признаку

2. отбирать по дефекту репарирования.

Индуцируемый мутагенез - путь совершенствования биообъектов радикальными методами. К таким методам относятся:

- обработка биообъекта химическими мутагенами, нацеленными на ДНК или ДНК-тропными агентами. После этой обработки число мутантов резко возрастает, как «положительных» так и « отрицательных». При этом у частимутантов резко изменяются признаки, причем, чем больше доза мутагена, тем больше и летальных, не нужных мутантов, но одновременно и больше процент выживших мутантов. Необходимо, чтобы сохранялся баланс между летальными мутациями и количеством выживших мутантов.

1. Химические мутагены:

а) нитрозогуанидин – алкилирует основания в репликативной вилке, вызывает мутации по типу трансверсии, транзиции и делеции,

б) нитрозометилмочевина – вызывает трансверсию

в) акридиновые красители (акридиновый оранжевый) – вставка другого гена между основаниями

г) некоторые противоопухолевые антибиотики, которые являются ДНК- тропными агентами.

2.Физические мутагены:

а) УФ- облучение, при этом образуются димеры пиридиновых оснований, идут мутации по типу транзиции и трансверсии. Изменяется порядок считывания генов на уровне трансляции.

б) рентгеновское облучение

в) быстрые нейтроны

г) g-лучи (Со)

д) ультразвук.

Мутационно-ступенчатый отбор – при этом отборе повышается частота мутаций. С помощью этого метода удалось добиться увеличения активности продуцента пенициллина в 100 000 раз за счет амплификации (умножения) генов, кодирующих образование LLD- трипептида, увеличивается производство пенициллина, а также нарушается система ретроингибирования, повышается проницаемость стенки.

Мутосинтез и мутосинтоны представляют направление в создании новых лекарственных средств как мутогенез. Можно привести пример получения мутосинтонов на основе аминогликозидов, формула которых представлена аминоциклитолом (устойчивая часть молекулы аминогликозида) и различными сахарами (легко изменяемая часть в структуре молекулы). Работа заключается в том, что сначала генетики удаляют аминоциклитол из структуры антибиотика, получая блок-мутанты, затем химики преобразуют аминоциклитол и далее биотехнологии соединяют в новую структуру антибиотика новый аминоциклитол и сахара в мультиферментных комплексах, где и происходит сборка новой молекулы антибиотика.

 

Цели, которые необходимо достигать биотехнологу при совершенствовании продуцента:

1. Увеличение продуктивности в достижении большого выхода лекарственных веществ на единицу биомассы.

2. Придать продуценту способность использовать менее дефицитные и более дешевые среды.

3. Продуцент не должен ретроингибировать биосинтез конечного продукта.

4. Устойчивость продуцента к вирусным инфекциям (бактериофагам).

5. Нетребовательность к оборудованию, т.е. биосинтез не должен снижаться при несовременной технологии оборудования (например, достижение меньшей вспениваемости культуральной жидкости)

6. Оптимизация свойств продуцента в аспекте медицинской промышленности (продуцент не должен иметь неприятного запаха и т.д.)

Главный тезис биотехнолога: увеличение выхода продукта на единицу биомассы продуцента.

 

⇐ Предыдущая12345678910Следующая ⇒

Поделиться: