На этом основании часто говорят,что катализатор снижает энергию активации реакции(в присутствии катализатора реакцию с высокой энергией активации заменяет реакция с низкой энергией активации).

Образование фермент-субстратного комплекса.(ESкомплекса)Ферментативная реакция начинается с образования промежуточного комплекса фермент-субстрат.Субстрат связан с определенным участком фермента(активным центром-зоной молекулы фермента,которая специфически взаимодействует с субстратом.В активном центре различают участок,ответственный за присоединение субстрата(центр связывания),и каталитический центр,отвечающий за химические превращения субстрата).Связывание субстрата с активным центром происходит в нескольких точках(чем выше специфичность фермента,тем больше точек узнавания),это приводит к деформации субстрата,и,следовательно,к его активации(снижению стабильности).В результате субстрат преобразуется в новый продукт,который утрачивает сродство к активному центру фермента.Снижение или утрата сродства приводит к высвобождению фермента и продуктов реакции.

1)E+S E-S (образование энзим субстратного комплекса),2)E-S E-P (образование комплекса энзим-продукты,возникшее вследствие дестабилизации или активации субстрата).3)E-P  E+P (высвобождение продукта реакции и энзима).

В образовании ES комплекса принимают участие ионные-гидрофобные взаимодействия.Между субстратом и ферментов,как правило,слабые связи.

 

22.  Типы ферментативных реакций. Механизмы 2-х субстратных реакций. Механизм ферментативного действия пиридоксаль-зависимого фермента аланинаминотрансферазы.

1)Односубстратная: AB= A + B односубстратные 2-хпродуктные; A→B односубстратные однопродуктные (изомеризация)

2)Двусубстратные (большинство): AB↔CD.

В зависимости от последовательности

По механизму протекания

Механизм двойного замещения («пинг-понг»)

Последовательного замещения

Механизмы ферментативного действия аланиламинотрансфеназы

 

Общие черты активного центра:

1) А.ц. формируется из участков пептидной цепи и отдельных аминокислотных остатков, содержащих разные функциональные группы. Субстрат, соединяется с активным центром в нескольких точках; это обеспечивает высокую избирательность связывания (комплементарность субстрата и активного центра) и ориентацию субстрата и а.ц.) и ориентацию субстрата, необходимую для катализа реакции.

А.ц. как правило располагается в углублении (в нише, в щели) поверхности фермента. В результате субстрат, соединяясь с а.ц., оказывается не в водной среде цитозоля клетки, а в специфическом окружении функциональных групп а.ц.

В ходе присоединения субстрата и в ходе катализа происходят конформационные изменения молекулы фермента и субстрата. До взаимодействия пространственная структура структура субстрата и а.ц. лишь приблизительно соответствовали друг другу; строгая комплементарность возникает в процессе взаимодействия в результате изменений конформации (индуцированное соответствие). Конформационные изменения могут способствовать растягиванию разрываемой связи или, наоборот, сближению молекул при реакциях синтеза и тем самым вносят вклад в ускорение реакции.

 

23.  Кинетика ферментативных реакций. Единицы активности. Измерение скорости реакции. Способы определения активности ферментов.

Скорость ферментативных реакций определяется посредством введения прореагировавших веществ за определенное время при определенных условиях. Измеряют по убыли субстрата S или приросту продукта P за единицу времени. Зависит от активности фермента. Активность фермента выражается в ед. ферментативной активности. Каталитическая активность фермента катализирует 1 моль субстрата за 1 сек. Моль/сек (кат). Хмкмоль/сек*л – Х мкмлоь субстрата, преобразованные в 1 л. За 1 сек. E=ME+мкмоль/мин.

Активность ЛДГ. 120 U/L 1мкат/л=60 U/L Xмкат/л= 120 U/L. Удельная активность фермента

⇐ Предыдущая3456789101112Следующая ⇒

Поделиться: