Электронно-микроскопическая визуализация и идентификация наночастиц в тонкой структуре природных биопленок
Природные биопленки в окружающей среде представляют собой органические образования на поверхности некоторых конструкционных элементов промышленных и жилых зданий, на поверхности сооружений из кирпича, камня, бетона, металла, керамики, дерева, пластмассы, а также на поверхности отдельных агрегатов и деталей технологических линий, машин и приборов, образовавшихся в процессе жизнедеятельности природных (диких) микробов или ассоциаций бактерий, дрожжей, грибов и одноклеточных водорослей. В структуре природных биопленок микробы ассимилируют или депонируют все то, что содержатся в воздухе, воде, почве: химические элементы, наночастицы, органические молекулы, продукты распада и разложения материалов и т.д.
Целью является определение наличия наночастиц в структуре природных биопленок, проведение структурной и морфометрической идентификация частиц в структуре биопленок и в живых микроорганизмах (бактериях, дрожжах, грибах и одноклеточных водорослях).
Образцы биопленки объемом 1-2 мм3 (10-15 кусочков) или биомассу в количестве 100-150 мг, собранную с поверхности конструкционных агрегатов или материалов, фиксируют и инактивируют 4, 0 % раствором глутарового альдегида на 0, 01 моль какодилатном буфере (рН 7, 2).
Схема проведения экспериментов электронно-микроскопической визуализации и идентификации наночастиц в природных биопленках представлена в таблице 12.
Таблица 12
Схема проведения экспериментов по электронно-микроскопической визуализации и идентификации наночастиц в тонкой структуре природных биопленок
Вид исследуемого материала
| Биопленка или биомасса микроорганизмов, собранная с поверхности конструкционных материалов
|
Физическая форма исследуемого материала
| Сухая или влажная биопленка (биомасса)
|
Количество материала для выполнения исследований
| 100-150 мг сухой или влажной биомассы или 10-15 кусочков биопленки величиной 1-2 мм3
|
Приборное обеспечение
| Электронный микроскоп по п.6.1.1.; дополнительное оборудование по п.6.2.4.
|
Материалы
| Пинцет для электронно-микроскопических работ, электронно-микроскопические сеточки, пластинка тефлона размером 10× 20 см, микропипетка вместимостью 50 мм3, наконечники к микропипетке, колбы вместимостью 100 см3, пробирки вместимостью 20 см3, пипетки
|
Химические реактивы
| Глутаровый альдегид, четырехокись осмия, какодилат натрия, этиловый спирт, абсолютный этиловый спирт или 100, 0 % ацетон, эпоксидные смолы (аралдит или эпон), формвар, коллодий, амилацетат, дихлорэтан, уранилацетат, цитрат свинца, дистиллированная вода
|
репарирование образцов для исследования в электронном микроскопе
| Этап 1(подготовка реактивов и материалов к эксперименту):
– приготовление 4, 0 % раствора глутарового альдегида на 0, 01 моль какодилатном буфере (рН 7, 2);
– приготовление 2, 0 % раствора четырехокиси осмия на 0, 01 моль какодилатном буфере (рН 7, 2);
– приготовление батареи спиртов возрастающей концентрацией;
– приготовление смеси абсолютного спирта и эпоксидной смолы (аралдита);
– заливочная эпоксидная смола;
– приготовление 0, 15 % раствора формвара на дихлорэтане или 0, 5 % раствора коллодия на амилацетате;
– покрытие электронно-микроскопических сеточек формваровой (коллодиевой) пленкой;
– приготовление 1, 0 % раствора уранилацетата;
–приготовление раствора цитрата свинца;
– приготовление эпоксидной смолы
Этап 2 (препарирование образцов для электронной микроскопии):
– биомассу бактерий фиксируют и инактивируют в 4, 0 % растворе глутарового альдегида на 0, 01 моль какодилатном буфере (рН 7, 2);
– бактерии дофиксируют в 2, 0 % растворе четырехокиси осмия на ацетат-вероналовом буфере (по Ритер, Келенбергеру) (рН 6, 0) или на 0, 01 моль какодилатном буфере (рН 7, 2);
|
| – образцы бактерий дегидратируют в нескольких сменах этилового спирта с возрастающей концентрацией, образцы выдерживают в трех сменах абсолютного этилового спирта или ацетона;
– образцы бактерий пропитывают в трех сменах абсолютного этилового спирта и аралдита;
– образцы бактерий заключают в аралдит и полимеризуют в течение 72 час при температуре 60 º С;
– на ультрамикротоме стеклянным ножом из образцов биопленки получают ультратонкие срезы толщиной 30, 0-60, 0 нм;
– ультратонкие срезы монтируют на электронно-микроскопические сеточки, покрытые формваровой пленкой;
– ультратонкие срезы наноматериала окрашивают цитратом свинца и 1, 0 % раствором уранилацетата.
|
Исследование ультраструктуры биопленки в просвечивающем электронном микроскопе
| Согласно п.6.3.
|
Анализ электронно-микроскопических изображений
ультраструктуры природной биопленки
| Основные этапы:
– визуализация наночастиц на ультратонких срезах биопленки;
– морфометрический анализ наночастиц в структуре биопленки и клетках микроорганизмов;
– определение степени полиморфизма наночастиц в структуре биопленки и клетках микроорганизмов;
– определение степени агрегированности наночастиц в структуре биопленки;
– оценка степени загруженности микробов наночастицами (число наночастиц на одну клетку)
|
Основные параметры и характеристики наночастиц в структуре природной биопленки для выдачи заключения
| Структурные и морфометрические характеристики наноматериала:
– наличие частиц размерами 1, 0-100, 0 нм в природной биопленке;
– уровень электронно-оптической плотности частиц;
– форма частиц;
– коэффициент формы наночастиц;
– степень полиморфизма наночастиц в материале;
– степень агрегированности наночастиц в биопленке и в микробах;
–характер распределения частиц в микробах;
– степень загруженности микробов наночастицами;
– характер повреждений ультраструктуры микробов наночастицами;
–количество бактерий в биопленке с интактной ультраструктурой;
– число бактерий в биопленке с летальными повреждениями и др.
|
Результаты и заключение электронно-микроскопической визуализации и идентификации наночастиц в структуре биопленки содержат информацию о форме, структуре и размерах наночастиц в исследуемом материале, данные о степени агрегированности наночастиц, сведения о характере распределения наночастиц в биопленке, число частиц на один микроб, характер и степень повреждения микроорганизмов наночастицами, электронно-микроскопические изображения структуры биопленки, наночастиц и микробов.
VII. ПОРЯДОК ПРИМЕНЕНИЯ АТОМНО-ЭМИССИОННОЙ СПЕКТРОФОТОМЕТРИИ И МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ С ИНДУКТИВНО СВЯЗАННОЙ ПЛАЗМОЙ ПРИ КОЛИЧЕСТВЕННОМ ОПРЕДЕЛЕНИИ НАНОМАТЕРИАЛОВ
Перечень индикаторных химических элементов для различных типов искусственных наноматериалов
В таблице 13 представлен список искусственных наноматериалов, приоритетных с точки зрения их определения в объектах окружающей среды и приведены маркёрные химические элементы, позволяющие осуществить количественное определение наноматериалов данного типа.
Принадлежность наноматериала к определённому классу тестируется предварительно методами ПЭМ с использованием дополнительных аналитических опций
Таблица 13
Список приоритетных наноматериалов и соответствующих индикаторных химических элементов для определения методами МС-ИСП и АЭС
№№ п/п
| Тип наномате-риала
| Индикаторный химический элемент
| Возможности анализа (+/-)
| Предел обнаружения мг/кг образца
| Примечание
|
МС-ИСП
| АЭС
|
1.
| Наночастицы золота
| Au
| +++
| ++
| 1*10-6
| указаны пределы обнаруже-ния для современ-ных ИСП-МС измери-тельных комплек-сов с системами устранения полиатом-ных интерфе-ренций
|
2.
| Наночастицы серебра
| Ag
| +++
| ++
| 1*10-6
|
3.
| Наночастицы диоксида титана (анатаз, рутил)
| Ti
| +++
| ++
| 1*10-6
|
4
| Наночастицы диоксида кремния (кварц, кремнезём)
| Si
| +++
| ++
| 5*10-6
|
5
| Наночастицы оксида алюминия
| Al
| +++
| ++
| 1*10-6
|
6
| Магнитные наночастицы
| Fe
Co
Ni
| +++
| ++
| 3*10-6
|
7
| Наночастицы оксида церия
| Ce
| +++
| ++
| 1*10-6
|
8
| Наночастицы глин
| Al
| +++
| ++
| 1*10-6
|
9
| Квантовые точки
| Cd
Se
Te
As
| +++
| ++
| 1*10-6
|
|
10
| Наночастицы оксида цинка
| Zn
| +++
| ++
| 1*10-6
|
11
| Наночастицы оксида меди
| Cu
| +++
| ++
| 1*10-6
|
11
| Нанотрубки
| Fe
Co
Ni
Сu
| +++
| ++
| 1*10-6
|
Требования к используемой аппаратуре
Используемые аналитические комплексы должны иметь возможность высокоточного многоэлементного анализа в широком линейном динамическом диапазоне, а также встроенную систему удаления полиатомных интерференций, основанную на физическом (столкновительном) принципе.
Требования к вспомогательному оборудованию, помещениям, техническому оснащению
Вспомогательное оборудование должно предоставлять возможность проведения серийной пробоподготовки для элементного анализа. Комплект оборудования должен включать:
1. Весы, точность до 0, 0001 г
2. Весы, точность до 0, 001 г
3. Систему для измельчения (гомогенизации) пробы.
4. Систему очистки кислот
5. Систему микроволнового разложения проб с наборами сосудов, в зависимости от анализируемых объектов.
6. Набор дозаторов и пластиковой посуды для растворения проб.
7.4. Выбор оптимального метода пробоподготовки
Согласно мировой практике использования оборудования и литературным данным, оптимальной методикой пробоподготовки перед проведением элементного анализа является измельчение пробы и микроволновое разложение.